Multicenter quality control of hepatitis C virus protease inhibitor resistance genotyping. - Université de Bretagne Occidentale
Article Dans Une Revue Journal of Clinical Microbiology Année : 2013

Multicenter quality control of hepatitis C virus protease inhibitor resistance genotyping.

Sophie Vallet (1) , Sylvie Larrat (2) , Syria Laperche (3) , Hélène Le Guillou-Guillemette (4) , Florence Legrand-Abravanel , Françoise Bouchardeau (3) , Adeline Pivert , Cécile Henquell , Audrey Mirand , Elisabeth André-Garnier , Valérie Giordanengo (5) , Gisèle Lagathu (6) , Vincent Thibault (7) , Caroline Scholtes , Evelyne Schvoerer (8) , Catherine Gaudy-Graffin (9) , Sarah Maylin , Pascale Trimoulet (10) , Etienne Brochot (11, 12) , Sébastien Hantz (13) , Joël Gozlan (14) , Anne-Marie Roque-Afonso (15) , Patrick Soussan (16) , Jean-Christophe Plantier (17) , Charlotte Charpentier (18) , Stéphane Chevaliez (3, 19) , Philippe Colson (20) , Vincent Mackiewicz , Lina Aguilera , Sylvain Rosec (21) , Stéphanie Gouriou (1) , Nelly Magnat , Françoise Lunel-Fabiani (4) , Jacques Izopet (22) , Patrice Morand (2) , Christopher Payan (1) , Jean-Michel Pawlotsky (3, 19)
1 LUBEM - Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne
2 LVMS - Laboratoire de virologie moléculaire et structurale
3 Centre National de Référence Virus des hépatites B, C et Delta
4 Laboratoire de virologie
5 IPMC - Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire
6 Laboratoire de Virologie [Rennes] = Virology [Rennes]
7 CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
8 Laboratoire de Virologie
9 MAVIVHe - Morphogénèse et antigénicité du VIH, des Virus des Hépatites et Emergents
10 CHU Bordeaux - Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
11 Laboratoire de Virologie [CHU Amiens]
12 UVCF - Unité de Virologie clinique et fondamentale
13 Service de Bactériologie, Virologie, Hygiène [CHU Limoges]
14 CHU Saint-Antoine [AP-HP]
15 Laboratoire de virologie
16 Carcinogenèse Hépatique et Virologie Moléculaire
17 Laboratoire de virologie [Rouen]
18 Laboratoire de Virologie
19 IMRB - Institut Mondor de Recherche Biomédicale
20 URMITE - Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes
21 CIC - Brest - Centre d'Investigation Clinique
22 Laboratoire Virologie [CHU Toulouse]
Sophie Vallet
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Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne
Sylvie Larrat
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Laboratoire de virologie moléculaire et structurale
Syria Laperche
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Centre National de Référence Virus des hépatites B, C et Delta
Hélène Le Guillou-Guillemette
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Laboratoire de virologie
Florence Legrand-Abravanel
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Françoise Bouchardeau
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Centre National de Référence Virus des hépatites B, C et Delta
Adeline Pivert
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Cécile Henquell
  • Fonction : Auteur
Audrey Mirand
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Elisabeth André-Garnier
  • Fonction : Auteur
Valérie Giordanengo
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Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire
Gisèle Lagathu
  • Fonction : Auteur
Laboratoire de Virologie [Rennes] = Virology [Rennes]
Vincent Thibault
CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Caroline Scholtes
Evelyne Schvoerer
Laboratoire de Virologie
CV
Catherine Gaudy-Graffin
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1115576
  • IdRef : 119775425
Morphogénèse et antigénicité du VIH, des Virus des Hépatites et Emergents
Sarah Maylin
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Pascale Trimoulet
  • Fonction : Auteur
Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
Etienne Brochot
Laboratoire de Virologie [CHU Amiens]
Unité de Virologie clinique et fondamentale
Sébastien Hantz
  • Fonction : Auteur
Service de Bactériologie, Virologie, Hygiène [CHU Limoges]
Joël Gozlan
  • Fonction : Auteur
CHU Saint-Antoine [AP-HP]
Anne-Marie Roque-Afonso
  • Fonction : Auteur
Laboratoire de virologie
Patrick Soussan
Carcinogenèse Hépatique et Virologie Moléculaire
Jean-Christophe Plantier
Laboratoire de virologie [Rouen]
Charlotte Charpentier
  • Fonction : Auteur
Laboratoire de Virologie
Stéphane Chevaliez
  • Fonction : Auteur
Centre National de Référence Virus des hépatites B, C et Delta
Institut Mondor de Recherche Biomédicale
Philippe Colson
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 938930
Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes
Vincent Mackiewicz
  • Fonction : Auteur
Lina Aguilera
  • Fonction : Auteur
Sylvain Rosec
  • Fonction : Auteur
Centre d'Investigation Clinique
Stéphanie Gouriou
Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne
Nelly Magnat
  • Fonction : Auteur
Françoise Lunel-Fabiani
  • Fonction : Auteur
Laboratoire de virologie
Jacques Izopet
Laboratoire Virologie [CHU Toulouse]
Patrice Morand
  • Fonction : Auteur
Laboratoire de virologie moléculaire et structurale
Christopher Payan
Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne
Jean-Michel Pawlotsky
Centre National de Référence Virus des hépatites B, C et Delta
Institut Mondor de Recherche Biomédicale

Résumé

Hepatitis C virus (HCV) protease inhibitor resistance-associated substitutions are selected during triple-therapy breakthrough. This multicenter quality control study evaluated the expertise of 23 French laboratories in HCV protease inhibitor resistance genotyping. A panel of 12 well-defined blinded samples comprising two wild-type HCV strains, nine transcripts from synthetic NS3 mutant samples or from clinical strains, and one HCV RNA-negative sample was provided to the participating laboratories. The results showed that any laboratory with expertise in sequencing techniques should be able to provide reliable HCV protease inhibitor resistance genotyping. Only a 0.7% error rate was reported for the amino acid sites studied. The accuracy of substitution identification ranged from 75% to 100%, depending on the laboratory. Incorrect results were mainly related to the methodology used. The results could be improved by changing the primers and modifying the process in order to avoid cross-contamination. This study underlines the value of quality control programs for viral resistance genotyping, which is required prior to launching observational collaborative multicenter studies on HCV resistance to direct-acting antiviral agents.

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Soumis le : vendredi 24 janvier 2014-11:44:36

Dernière modification le : mercredi 30 octobre 2024-18:08:04

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Dates et versions

hal-00935958 , version 1 (24-01-2014)

Identifiants

Citer

Sophie Vallet, Sylvie Larrat, Syria Laperche, Hélène Le Guillou-Guillemette, Florence Legrand-Abravanel, et al.. Multicenter quality control of hepatitis C virus protease inhibitor resistance genotyping.. Journal of Clinical Microbiology, 2013, 51 (5), pp.1428-33. ⟨10.1128/JCM.03032-12⟩. ⟨hal-00935958⟩

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