Décrire la niche trophique occupée par les requins est fondamental dans la compréhension du contrôle trophique qu'ils exercent sur les communautés associées et des potentielles conséquences de leur surpêche sur le milieu marin. Dans cette thèse, l'habitat alimentaire de différentes espèces de requins a été étudié le long des côtes de Basse Californie du Sud (Mexique), une région où la pression de pêche sur ces prédateurs est forte. D’un point de vue écologique, l’idée directrice était de décrire l’importance de la répartition de la ressource dans la définition des niches trophiques à l’échelle intra- et inter-spécifique. Pour cela, plusieurs outils ont été utilisés tels que les isotopes stables du carbone, de l’azote et du mercure, ainsi que la composition en acides gras permettant la description verticale et horizontale des habitats alimentaires. À l’échelle intra-spécifique, la répartition de la ressource chez les requins marteaux juvéniles est liée à l’utilisation d’écosystèmes et de proies distincts au cours de la croissance. À l’échelle inter spécifique, elle s’exprime par des différences de profondeur d’alimentation au sein des assemblages pélagiques, mais dépend aussi des conditions environnementales telles que la présence d’upwelling. Ce travail a également conduit à une meilleure caractérisation du cycle de vie du requin marteau commun (Sphyrna zygaena), démontrant ainsi une vulnérabilité accrue aux pressions de pêche liée à une résidence prolongée en milieu côtier. Finalement, la complémentarité des marqueurs trophiques utilisés offre de prometteuses perspectives quant à l’étude des réseaux alimentaires.