Le chinchard, Trachurus murphyi constitue une espèce importante pour la pêcherie dans le sud-est de l'océan Pacifique. Dans cette thèse, la morphologie des ovocytes atrétiques, prévalence et l'intensité de l'atrésie ont été décrits. Les stades d'atrésie identifiés sont les stades alpha, bêta et gamma. Les modèles linéaires généraux ont montré que l’incidence des follicules pot-ovulatoires, la température de surface de la mer et le facteur mois/année, expliquent la prévalence et l'intensité. La dynamique des stades alpha et bêta-atrésie pourrait être considérée comme un indicateur potentiel de toute perturbation de la saison de frai de cette espèce. Cette étude constitue une première évaluation comparative de la fécondité entre les femelles atrétiques et non atrétiques pour cette espèce.La fécondité partielle et la fécondité relative sont inférieures à celles observées chez d’autres espèces de Trachurus. T. murphyi, la base de données transcriptomique (tissus du foie et des ovaires) a été générée. Cette étude a notamment permis d’identifier quelques marqueurs plus spécifiques de l'atrésie comme des protéines de liaison aux acides gras (FABP) et de la follistatine. L'analyse transcriptomique a démontré l'expression de gènes potentiellement associés à une infection par des protozoaires.L’ensemble du foie de T. murphyi est parasité par Goussia cruciata (Apicomplexa).L'abondance du parasite était corrélée négativement à la longueur totale de l'hôte. Une relation potentielle entre l’infection par les protozoaires et l’atrésie ne peut être établie.