A new molecular classification to drive precision treatment strategies in primary Sjögren’s syndrome
Perrine Soret
(1)
,
Christelle Le Dantec
(2)
,
Emiko Desvaux
(1, 2)
,
Nathan Foulquier
(2)
,
Bastien Chassagnol
(1)
,
Sandra Hubert
(1)
,
Christophe Jamin
(2)
,
Guillermo Barturen
(3)
,
Guillaume Desachy
(1)
,
Valérie Devauchelle-Pensec
(2, 4)
,
Cheïma Boudjeniba
(1)
,
Divi Cornec
(2, 4)
,
Alain Saraux
(2, 4)
,
Sandrine Jousse-Joulin
(2, 4)
,
Nuria Barbarroja
(5)
,
Ignasi Rodríguez-Pintó
(6)
,
Ellen de Langhe
(7)
,
Lorenzo Beretta
(8)
,
Carlo Chizzolini
(9)
,
László Kovács
(10)
,
Torsten Witte
(11)
,
Eléonore Bettacchioli
(12)
,
Anne Buttgereit
(13)
,
Zuzanna Makowska
(13)
,
Ralf Lesche
(13)
,
Maria Orietta Borghi
(14)
,
Javier Martin
(15)
,
Sophie Courtade-Gaiani
(1)
,
Laura Xuereb
(1)
,
Mickaël Guedj
(1)
,
Philippe Moingeon
(1)
,
Marta Alarcón-Riquelme
(16)
,
Laurence Laigle
(1)
,
Jacques-Olivier Pers
(2, 12)
,
Barbara Vigone
(14)
,
Bernard Lauwerys
,
Anne-Lise Maudoux
,
Carlos Vasconcelos
,
Ana Tavares
,
Raquel Faria
,
Mariana Brandão
,
Ana Campar
,
António Marinho
,
Fátima Farinha
,
Isabel Almeida
,
Miguel Angel Gonzalez-Gay Mantecón
,
Ricardo Blanco Alonso
,
Alfonso Corrales Martínez
,
Ricard Cervera
,
Gerard Espinosa
,
Rik Lories
,
Nicolas Hunzelmann
,
Doreen Belz
,
Niklas Baerlecken
,
Georg Stummvoll
,
Michael Zauner
,
Michaela Lehner
,
Eduardo Collantes
,
Rafaela Ortega-Castro
,
Ma Angeles Aguirre-Zamorano
,
Alejandro Escudero-Contreras
,
Ma Carmen Castro-Villegas
,
Yolanda Jiménez Gómez
,
Norberto Ortego
,
María Concepción Fernández Roldán
,
Enrique Raya
,
Inmaculada Jiménez Moleón
,
Enrique de Ramon
,
Isabel Díaz Quintero
,
Pier Luigi Meroni
,
Maria Gerosa
,
Tommaso Schioppo
,
Carolina Artusi
,
Aleksandra Zuber
,
Donatienne Wynar
,
Attila Balog
,
Magdolna Deák
,
Márta Bocskai
,
Sonja Dulic
,
Gabriella Kádár
,
Falk Hiepe
,
Silvia Thiel
,
Manuel Rodriguez Maresca
,
Antonio López-Berrio
,
Rocío Aguilar-Quesada
,
Héctor Navarro-Linares
,
Yiannis Ioannou
,
Chris Chamberlain
,
Jacqueline Marovac
,
Marta Alarcón Riquelme
,
Tania Gomes Anjos
,
Concepción Marañón
,
Lucas Le Lann
,
Quentin Simon
,
Bénédicte Rouvière
,
Nieves Varela
,
Brian Muchmore
,
Aleksandra Dufour
,
Montserrat Alvarez
,
Jonathan Cremer
,
Chary Lopez-Pedrera
,
Velia Gerl
,
Laleh Khodadadi
,
Qingyu Cheng
,
Aurélie de Groof
,
Julie Ducreux
,
Elena Trombetta
,
Tianlu Li
,
Damiana Alvarez-Errico
,
Katja Kniesch
,
Nancy Azevedo
,
Esmeralda Neves
,
Sambasiva Rao
,
Pierre-Emmanuel Jouve
1
IRIS -
Institut de Recherches Internationales Servier [Suresnes]
2 LBAI - Lymphocytes B, Autoimmunité et Immunothérapies
3 Centre for Genomics and Oncological Reearch (GENYO)
4 CHU - BREST - Rhumato - CHRU Brest - Service de Rhumatologie
5 IMIBIC - Instituto Maimonides de Investigación Biomédica de Cordoba
6 Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS)
7 KU Leuven - Catholic University of Leuven = Katholieke Universiteit Leuven
8 Maggiore Hospital, IRCCS Foundation, Milano
9 Department of Pathology and Immunology [Geneva, Switzerland]
10 University of Szeged [Szeged]
11 Clinic for Immunology and Rhematology, Hannover Medical School, Hanover, Germany
12 CHU - BREST - Hôpital Morvan - CHRU de Brest
13 Pharmaceuticals Division Bayer Pharma Aktiengesellschaft
14 UNIMI - Università degli Studi di Milano = University of Milan
15 IPBLN - Instituto de Parasitología y Biomedicina “López-Neyra”
16 UGR - Universidad de Granada = University of Granada
2 LBAI - Lymphocytes B, Autoimmunité et Immunothérapies
3 Centre for Genomics and Oncological Reearch (GENYO)
4 CHU - BREST - Rhumato - CHRU Brest - Service de Rhumatologie
5 IMIBIC - Instituto Maimonides de Investigación Biomédica de Cordoba
6 Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS)
7 KU Leuven - Catholic University of Leuven = Katholieke Universiteit Leuven
8 Maggiore Hospital, IRCCS Foundation, Milano
9 Department of Pathology and Immunology [Geneva, Switzerland]
10 University of Szeged [Szeged]
11 Clinic for Immunology and Rhematology, Hannover Medical School, Hanover, Germany
12 CHU - BREST - Hôpital Morvan - CHRU de Brest
13 Pharmaceuticals Division Bayer Pharma Aktiengesellschaft
14 UNIMI - Università degli Studi di Milano = University of Milan
15 IPBLN - Instituto de Parasitología y Biomedicina “López-Neyra”
16 UGR - Universidad de Granada = University of Granada
Christophe Jamin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 2136
- IdHAL : christophe-jamin
- ORCID : 0000-0002-9494-3223
- IdRef : 116289511
Valérie Devauchelle-Pensec
- Fonction : Auteur
- PersonId : 766858
- ORCID : 0000-0003-0432-825X
Divi Cornec
- Fonction : Auteur
- PersonId : 766860
- ORCID : 0000-0002-9159-702X
Alain Saraux
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762362
- ORCID : 0000-0002-8454-7067
Sandrine Jousse-Joulin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 766854
- ORCID : 0000-0002-5479-5887
Carlo Chizzolini
- Fonction : Auteur
- PersonId : 767598
- ORCID : 0000-0003-4849-6335
Jacques-Olivier Pers
- Fonction : Auteur
- PersonId : 753610
- IdHAL : jacques-olivier-pers
- ORCID : 0000-0001-7287-5541
- IdRef : 068262159
Bernard Lauwerys
- Fonction : Auteur
Anne-Lise Maudoux
- Fonction : Auteur
Carlos Vasconcelos
- Fonction : Auteur
Ana Tavares
- Fonction : Auteur
Raquel Faria
- Fonction : Auteur
Mariana Brandão
- Fonction : Auteur
Ana Campar
- Fonction : Auteur
António Marinho
- Fonction : Auteur
Fátima Farinha
- Fonction : Auteur
Isabel Almeida
- Fonction : Auteur
Miguel Angel Gonzalez-Gay Mantecón
- Fonction : Auteur
Ricardo Blanco Alonso
- Fonction : Auteur
Alfonso Corrales Martínez
- Fonction : Auteur
Ricard Cervera
- Fonction : Auteur
Gerard Espinosa
- Fonction : Auteur
Rik Lories
- Fonction : Auteur
Nicolas Hunzelmann
- Fonction : Auteur
Doreen Belz
- Fonction : Auteur
Niklas Baerlecken
- Fonction : Auteur
Georg Stummvoll
- Fonction : Auteur
Michael Zauner
- Fonction : Auteur
Michaela Lehner
- Fonction : Auteur
Eduardo Collantes
- Fonction : Auteur
Rafaela Ortega-Castro
- Fonction : Auteur
Ma Angeles Aguirre-Zamorano
- Fonction : Auteur
Alejandro Escudero-Contreras
- Fonction : Auteur
Ma Carmen Castro-Villegas
- Fonction : Auteur
Yolanda Jiménez Gómez
- Fonction : Auteur
Norberto Ortego
- Fonction : Auteur
María Concepción Fernández Roldán
- Fonction : Auteur
Enrique Raya
- Fonction : Auteur
Inmaculada Jiménez Moleón
- Fonction : Auteur
Enrique de Ramon
- Fonction : Auteur
Isabel Díaz Quintero
- Fonction : Auteur
Pier Luigi Meroni
- Fonction : Auteur
Maria Gerosa
- Fonction : Auteur
Tommaso Schioppo
- Fonction : Auteur
Carolina Artusi
- Fonction : Auteur
Aleksandra Zuber
- Fonction : Auteur
Donatienne Wynar
- Fonction : Auteur
Attila Balog
- Fonction : Auteur
Magdolna Deák
- Fonction : Auteur
Márta Bocskai
- Fonction : Auteur
Sonja Dulic
- Fonction : Auteur
Gabriella Kádár
- Fonction : Auteur
Falk Hiepe
- Fonction : Auteur
Silvia Thiel
- Fonction : Auteur
Manuel Rodriguez Maresca
- Fonction : Auteur
Antonio López-Berrio
- Fonction : Auteur
Rocío Aguilar-Quesada
- Fonction : Auteur
Héctor Navarro-Linares
- Fonction : Auteur
Yiannis Ioannou
- Fonction : Auteur
Chris Chamberlain
- Fonction : Auteur
Jacqueline Marovac
- Fonction : Auteur
Marta Alarcón Riquelme
- Fonction : Auteur
Tania Gomes Anjos
- Fonction : Auteur
Concepción Marañón
- Fonction : Auteur
Lucas Le Lann
- Fonction : Auteur
Quentin Simon
- Fonction : Auteur
Bénédicte Rouvière
- Fonction : Auteur
Nieves Varela
- Fonction : Auteur
Brian Muchmore
- Fonction : Auteur
Aleksandra Dufour
- Fonction : Auteur
Montserrat Alvarez
- Fonction : Auteur
Jonathan Cremer
- Fonction : Auteur
Chary Lopez-Pedrera
- Fonction : Auteur
Velia Gerl
- Fonction : Auteur
Laleh Khodadadi
- Fonction : Auteur
Qingyu Cheng
- Fonction : Auteur
Aurélie de Groof
- Fonction : Auteur
Julie Ducreux
- Fonction : Auteur
Elena Trombetta
- Fonction : Auteur
Tianlu Li
- Fonction : Auteur
Damiana Alvarez-Errico
- Fonction : Auteur
Katja Kniesch
- Fonction : Auteur
Nancy Azevedo
- Fonction : Auteur
Esmeralda Neves
- Fonction : Auteur
Sambasiva Rao
- Fonction : Auteur
Pierre-Emmanuel Jouve
- Fonction : Auteur
Résumé
Abstract There is currently no approved treatment for primary Sjögren’s syndrome, a disease that primarily affects adult women. The difficulty in developing effective therapies is -in part- because of the heterogeneity in the clinical manifestation and pathophysiology of the disease. Finding common molecular signatures among patient subgroups could improve our understanding of disease etiology, and facilitate the development of targeted therapeutics. Here, we report, in a cross-sectional cohort, a molecular classification scheme for Sjögren’s syndrome patients based on the multi-omic profiling of whole blood samples from a European cohort of over 300 patients, and a similar number of age and gender-matched healthy volunteers. Using transcriptomic, genomic, epigenetic, cytokine expression and flow cytometry data, combined with clinical parameters, we identify four groups of patients with distinct patterns of immune dysregulation. The biomarkers we identify can be used by machine learning classifiers to sort future patients into subgroups, allowing the re-evaluation of response to treatments in clinical trials.